Buffarna gällde flygningar från Grekland till Storbritannien, men riktade sig särskilt till lågprisbolag och flyg till eller från Bulgarien, Tjeckien och Italien.
Tre flygningar omdirigerades men alla jetplanen landade säkert utan att några sprängämnen hittades.
Inget ansvarsanspråk gjordes för alla flygningar, men ett hot mot två flygningar som skickats till flygplatser i Rom och publicerats av en italiensk tidning innehöll kvinnofientliga meddelanden.
Under eskort, omläggningar
Minst fem flygningar fick flygvapeneskort efter att ha mottagit bombhot.
Bulgariens flygvapen eskorterade tre Ryanair-plan på väg mot Sofia från Madrid, Köpenhamn och London Stansted. Alla tre planen inspekterades och inga sprängämnen hittades, säger en talesperson för inrikesministeriet till AFP.
Franska jaktplan följde med en Aer Lingus-flygning från Dublin som var på väg till Rom och avledde den till militärbasen Evreux 100 kilometer (60 miles) väster om Paris.
Även andra jetplan avleddes.
Ryanair-flyget från London-Stansted till Sofia omdirigerades till Plovdivs flygplats, öster om huvudstaden, medan ett Wizz Air-flyg från Milano till Warszawa omdirigerades till Wien, sa flygbolagen.
Vem och varför?
Den italienska tidningen Il Corriere della Sera publicerade texten i ett meddelande som skickades till ADR, företaget som förvaltar Roms flygplatser. En företagskälla bekräftade rapporten till AFP.
”Ni är alla medbrottslingar i en kriminell konspiration, och för detta vill vi förinta er. Just nu har sprängladdningar placerats på följande flygningar: AY1751 Helsingfors–Rom och EI402 Dublin–Rom”, löd meddelandet, med media som noterade att det var skrivet på ”bruten italienska”.
”Vi Male State-krigare med våra handlingar idag kommer att lämna spår i historien. Din feministiska regim kommer att minnas det för alltid. Explosionen kommer att inträffa om 60 minuter. Idag kommer din himmel att vara röd”, löd texten.
Det finns en högerextrem rörelse i Ryssland som kallas Male State, men AFP kunde inte bekräfta någon länk till meddelandet.
Prags flygplatstalesperson Denisa Hejtmankova sa till AFP att flygplatsen hade mottagit hot i e-postmeddelanden från anonyma adresser.
EU:s transportkommissionär, Apostolos Tzitzikostas, skrev den X att det var ”för tidigt att dra slutsatser om huruvida de rapporterade incidenterna har ett samband”.
Men europeiska myndigheter säger att det har skett en ökning av hybridattacker, ibland kopplade till Ryssland eller Iran.
Landar säkert
De flesta flygningar som var inriktade på torsdagen landade utan incidenter på sina ursprungliga destinationer.
Dessa inkluderade ett Lot Polish Airlines-flyg från Warszawa till Bryssel och ett Wizz Air-flyg från Milano till Bukarest.
I Tjeckien landade fyra riktade plan på väg till Prag med Ryanair, Easy Jet och Sky Express alla säkert.
”Vi uppfattar hotens trovärdighet som låg”, sade tjeckisk polis på X. ”Ändå underskattar vi inte situationen, och alla nödvändiga säkerhetsåtgärder har aktiverats.”
Dansk polis sa att två hotade plan landade i Köpenhamn som planerat. – Vår bedömning är att det inte finns någon fara, och det har aldrig varit någon fara, för passagerare eller någon annan på flygplatsen, säger Köpenhamnspolisen till AFP.
I Grekland sa Aegean Airlines att deras flygningar från Thessaloniki till Milano och från Aten till Wien hade mottagits ”ogrundade” hot.
Hot riktades mot tre flygningar kopplade till Madrid, även om den spanska flygplatsoperatören Aena avböjde att namnge flygbolagen eller ge andra detaljer om flygningarna. Det var inte omedelbart klart om de tre flygningarna inkluderade Ryanairs Madrid-Sofia-flyg.
Bekymrade resenärer
Resenärer på Roms flygplats Fiumicino uttryckte blandade känslor över hoten.
”Det är mycket oroande, vi är mycket oroade över säkerheten i Europa i allmänhet, så det är väldigt rädd att vara här”, säger brasilianska Natalia Lobo, 29, till AFP.
Den franska resenären Ella Germain, 20, sa att nyhetsrapporterna bara hade skapat ”lite oro”.
Flygningarna utgjorde en liten procentandel av Europas flygtrafik på torsdagen. Cirka 25 072 flygningar var planerade över hela kontinenten, enligt Eurocontrol, kontinentens flygsäkerhetsorgan.
Tidigare hot
På tisdagen var 10 flygningar utsatta för bombhot. Allt visade sig vara bluff.
Varningarna tvingade fram stängningen av en flygplats i Warszawa och utplaceringen av det italienska flygvapnets jetplan för att skydda flygningar.
På måndagen omdirigerades ett Wizz Air-flyg från Londons flygplats Luton till Sofia på grund av ett bombhot och gjorde ett nödstopp i Budapest.
